L’épigénétique s’intéresse à l’altération de l’expression de certains gènes, sans modifications dans la séquence de l’ADN. De telles altérations se manifestent par la modification de certaines bases de l’ADN. La méthylation de la cytidine, entrainant la formation de 5-methylcytidine, est une de ces modifications courantes. La 5-methylcytidine est donc un marqueur régulièrement utilisé dans l’évaluation des dommages de l’ADN. Ce type de dommages est associé à un risque de survenue de maladies, notamment le cancer. L’ADN peut être réparé par l’organisme au travers d’une suite de réaction. La 5-méthylcytidine passe alors par plusieurs intermédiaires avant d’être éliminée : la 5-hydroxymethylcytidine, la 5-formylcytidine et la 5-carboymethylcytidine (Kubik et al. 2015).

La méthode développée par la plateforme PRISMM utilise la chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem (LC-MS/MS). Cette méthode permet le dosage de la 5-methylcytidine et de ses 3 dérivés dans des échantillons d’ADN hydrolysés extraits des cellules mononuclées du sang. La méthode est complétée par le dosage simultané de deux types de marqueurs de génotoxicité : des adduits d’oxydations ainsi que des adduits aux HAP. La plateforme est capable de gérer un grand nombre d’échantillons par l’utilisation d’une méthode de dosage optimisée et validée utilisant des techniques d’automatisation.

Kubik G, Summerer D. Deciphering Epigenetic Cytosine Modifications by Direct Molecular Recognition. ACS Chem Biol. 17 juill 2015;10(7):1580 9.

Hilgert Jacobsen-Pereira C, dos Santos CR, Troina Maraslis F, Pimentel L, Feijó AJL, Iomara Silva C, et al. Markers of genotoxicity and oxidative stress in farmers exposed to pesticides. Ecotoxicology and Environmental Safety. févr 2018;148:177 83.

Le Goff J, André V, Lebailly P, Pottier D, Périn F, Périn O, et al. Seasonal variations of DNA-adduct patterns in open field farmers handling pesticides. Mutation Research/Genetic Toxicology and Environmental Mutagenesis. nov 2005;587(1 2):90 102.